Fenerbahçe Spor Kulübü tarafından kurulmuş olan "Fenerbahçe Eğitim, Kültür ve Sağlık Vakfı", Yükseköğretim Kurulu’ndan Fenerbahçe Üniversitesi’nin kuruluş iznini almış olup, Üniversitemiz 24 Kasım 2016 tarihli Resmi Gazetede yayımlanan Kanun ile kamu tüzel kişiliğini kazanmıştır.